More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a003 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  57.71 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  39.3 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  33.88 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  31.89 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  32.14 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  34.24 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.54 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  32.69 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.79 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.12 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  36.24 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  32.18 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  31.13 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  31.14 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  28.86 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  27.41 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.77 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  31.32 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  31.13 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  32.45 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  32.45 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  34.46 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.46 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.58 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.12 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  29.67 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  30.22 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  30.22 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.72 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  29.12 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.46 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  29.12 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  31.87 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  29.12 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.05 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.89 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  31.54 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  30.22 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  33.56 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  31.58 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.87 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  30.51 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  29.48 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  28.48 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  28.67 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.08 
 
 		 309 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  30.51 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  33.11 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  28.87 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  27.75 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  32.67 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  27.78 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.52 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  31.21 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.45 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  30.07 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  31.54 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  27.78 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  28.89 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  29.73 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  30.26 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  29.3 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  28.65 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>