121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a002 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.96 
 
 		 1669 aa  811    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  32.19 
 
 		 1669 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.24 
 
 		 1726 aa  751    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  29.74 
 
 		 1706 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.94 
 
 		 1703 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  31.11 
 
 		 1700 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.52 
 
 		 1925 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  29.52 
 
 		 1649 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  31.34 
 
 		 1642 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  81.43 
 
 		 1932 aa  3202    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1748 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.1 
 
 		 1702 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  40.54 
 
 		 2117 aa  1216    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.03 
 
 		 1697 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  31.99 
 
 		 1722 aa  708    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  100 
 
 		 1934 aa  3942    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  30.77 
 
 		 1701 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  30.63 
 
 		 1697 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 		 1693 aa  696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  36.08 
 
 		 2098 aa  824    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  35.89 
 
 		 2077 aa  828    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 1516 aa  627  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  29.56 
 
 		 1606 aa  622  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 1575 aa  612  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.61 
 
 		 1417 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 2570 aa  599  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 1674 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  26.97 
 
 		 1956 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  30.77 
 
 		 2274 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  28.6 
 
 		 1211 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  30.04 
 
 		 2005 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 1594 aa  373  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 976 aa  346  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  33.64 
 
 		 761 aa  269  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  31.17 
 
 		 763 aa  259  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  38.89 
 
 		 766 aa  258  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  30.23 
 
 		 470 aa  167  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.5 
 
 		 526 aa  130  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  24.74 
 
 		 1328 aa  104  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  23.51 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  29.63 
 
 		 284 aa  76.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  24.27 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  22.79 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  27.09 
 
 		 254 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  22.97 
 
 		 481 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.93 
 
 		 479 aa  56.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  35.05 
 
 		 894 aa  56.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  31.58 
 
 		 246 aa  56.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  29.32 
 
 		 481 aa  56.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.88 
 
 		 489 aa  55.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  26.85 
 
 		 518 aa  55.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 530 aa  55.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.59 
 
 		 1379 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 518 aa  55.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 518 aa  55.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  27.98 
 
 		 488 aa  54.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 518 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 518 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 477 aa  54.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  30.28 
 
 		 958 aa  54.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 958 aa  54.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  24.56 
 
 		 515 aa  53.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 523 aa  53.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  23.11 
 
 		 515 aa  53.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 523 aa  53.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 479 aa  53.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 493 aa  52.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 1105 aa  52.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 484 aa  52.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.88 
 
 		 493 aa  52.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.72 
 
 		 933 aa  51.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.58 
 
 		 339 aa  52  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  26.52 
 
 		 341 aa  51.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  22.56 
 
 		 1111 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 501 aa  51.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 500 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 1108 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  26.52 
 
 		 341 aa  51.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  24.88 
 
 		 666 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 515 aa  50.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  25.23 
 
 		 523 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25 
 
 		 527 aa  50.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  39.39 
 
 		 900 aa  49.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  23.63 
 
 		 517 aa  49.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 969 aa  49.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 892 aa  48.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  30.26 
 
 		 898 aa  48.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  23.64 
 
 		 486 aa  48.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.26 
 
 		 898 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.58 
 
 		 971 aa  48.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 522 aa  48.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  23.67 
 
 		 969 aa  47.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.88 
 
 		 1069 aa  48.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 488 aa  47.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 1069 aa  48.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 905 aa  48.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.21 
 
 		 530 aa  48.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 919 aa  47.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>