More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1569 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1569  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 396 aa  810    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0191  recombination factor protein RarA  71.5 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0229  recombination factor protein RarA  71.25 
 
 		 393 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0208  recombination factor protein RarA  70.99 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  66.07 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  59.59 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  59.49 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  59.65 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  54.41 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  40.39 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  39.18 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  39.29 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  38.18 
 
 		 446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  38.3 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  37.44 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  35.56 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  37.65 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  38.61 
 
 		 432 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  36.3 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  38.34 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  38.01 
 
 		 446 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  40.25 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  38.27 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  38.42 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  35.4 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 441 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  38.63 
 
 		 419 aa  252  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  38.13 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  38.18 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  39.55 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  37.29 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  37.25 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  35.94 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  39.8 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  38.83 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  39.51 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  36.25 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  39.49 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  35.65 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  36.97 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  38.04 
 
 		 457 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  38.85 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  36.32 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  37.94 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  36.34 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  36.45 
 
 		 432 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  37.19 
 
 		 404 aa  246  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  39.44 
 
 		 422 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  34.68 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  35.14 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  36.02 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  36.02 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  38.6 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  36.41 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  35.43 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  38.12 
 
 		 447 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  39.35 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  35.17 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  36.58 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  36.49 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  37.53 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  37.38 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.13 
 
 		 599 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  37.1 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.13 
 
 		 599 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  37.69 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.68 
 
 		 731 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  36.63 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  37.96 
 
 		 432 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  35.01 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  35.1 
 
 		 432 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  35.66 
 
 		 484 aa  232  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  38.81 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  36.18 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  36.59 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  36.91 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  35.58 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  33.57 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  33.57 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  33.57 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  38.01 
 
 		 429 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  35.53 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  35.14 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  35.14 
 
 		 463 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  35.77 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.65 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  33.81 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  35.98 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  37.83 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  32.14 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  34.85 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.53 
 
 		 726 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  36.29 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  36.29 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  36.25 
 
 		 412 aa  223  7e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 		 445 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  35.71 
 
 		 465 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>