More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1567 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1567  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 445 aa  899    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  85.84 
 
 		 445 aa  777    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  71.3 
 
 		 446 aa  649    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  86.29 
 
 		 451 aa  778    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1597  phosphoglucosamine mutase  85.39 
 
 		 445 aa  770    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  71.52 
 
 		 446 aa  634  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  69.21 
 
 		 446 aa  617  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1717  phosphoglucosamine mutase  68.76 
 
 		 446 aa  616  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0078  phosphoglucosamine mutase  64.72 
 
 		 446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2039  phosphoglucosamine mutase  60.76 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  46.44 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  49.07 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  47.11 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  48.86 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  47.31 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  46.54 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  46.51 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  46.54 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  46.1 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  47.43 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  47.43 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  45.39 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  48.37 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  47.9 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  46 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  47.79 
 
 		 453 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  45.68 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  46.06 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  45.62 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  45.21 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  46 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  46.19 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  45.5 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  45.68 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  45.52 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  45.45 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  46.91 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  46.22 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  45.69 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  44.93 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  47.09 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  45.39 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  46.44 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  46.44 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  44.14 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  46.68 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  45.22 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  45.88 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  45.79 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  46.76 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  44.93 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  45.35 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  45.68 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  45.77 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  45.35 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  46.79 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  45.12 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  44.01 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  45.27 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  46.37 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  44.81 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  44.59 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  44.68 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  43.91 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  44.88 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  47.24 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  45.41 
 
 		 450 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  44.88 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  44.55 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  44.21 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  44.73 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  44.91 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  45.6 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  43.58 
 
 		 449 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  45.67 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  46.74 
 
 		 447 aa  359  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  44.6 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  44.76 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  44.78 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  44.65 
 
 		 447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  44.96 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  45.56 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  43.9 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  43.96 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  46.24 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  43.12 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  44.19 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  45.5 
 
 		 445 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  43.02 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  44.5 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  43.12 
 
 		 447 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>