290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1566 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1566  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0384  lipoprotein signal peptidase  62.76 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  62.07 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  60.69 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0743  lipoprotein signal peptidase  57.72 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1790  lipoprotein signal peptidase  56 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434015  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1716  lipoprotein signal peptidase  63.12 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.463602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1808  lipoprotein signal peptidase  58.02 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.154233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0079  lipoprotein signal peptidase  55.91 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2038  lipoprotein signal peptidase  54.01 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 358 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  29.81 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  28.21 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  32.67 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.12 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  28.66 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  29.3 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  29.75 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  27.45 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  28.19 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  29.75 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  31.48 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.73 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  28.19 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  32.7 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  31.51 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>