228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1551 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  313  7e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0423  putative nucleotide-binding protein  82.82 
 
 		 163 aa  260  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0398  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 		 163 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.167613  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1583  putative nucleotide-binding protein  80.98 
 
 		 163 aa  255  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  63.64 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  61.82 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  59.39 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0092  protein of unknown function DUF520  47.27 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0039  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  40.61 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.12 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  43.45 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  38.36 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  38.36 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  39.39 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  38.36 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  35.85 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  38.36 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  40.25 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  36.31 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  38.36 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  36.25 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  40.48 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  39.41 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  37.95 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  36.31 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  38.99 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>