38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1522 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  84.07 
 
 		 408 aa  690    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  84.31 
 
 		 408 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  833    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  84.07 
 
 		 408 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  72.2 
 
 		 412 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  71.88 
 
 		 411 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  70.59 
 
 		 406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  66.67 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  61.61 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  45.32 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  41.9 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  37.18 
 
 		 416 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  37.53 
 
 		 412 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  34.68 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  36.21 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  33.25 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  34.96 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  33.25 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  31.38 
 
 		 396 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  22.45 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  28.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  25.95 
 
 		 199 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  27.82 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  30.84 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  29.31 
 
 		 195 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>