189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1519 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  100 
 
 		 335 aa  679    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  61.61 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  61.61 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  60.71 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  51.33 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  41.45 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  33.73 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 		 221 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  41.53 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.88 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.2 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30.25 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.21 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  53.97 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  44.44 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  37 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  37 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  43.75 
 
 		 169 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  39.29 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  36.19 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  49.02 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  46.67 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  43.86 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  38.55 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1520  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  33.98 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2020  flagellar hook capping protein  31.9 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.292444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  44.74 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  44.74 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  44.74 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  32.99 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  28.44 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  29.36 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  46.15 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  27.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  33.98 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  39.47 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  43.48 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  37.38 
 
 		 134 aa  57  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  42.17 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  28.09 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.04 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  28.44 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  31.19 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  47.06 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  43.64 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  45.28 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  45.1 
 
 		 185 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  35.79 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  28.85 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  35.79 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  40 
 
 		 139 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  40.32 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  43.1 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  40.32 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 138 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  30.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  42.59 
 
 		 131 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  44.44 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  35.37 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  27.97 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  39.06 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  31.37 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.96 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  41.38 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  35.63 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  37.84 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.14 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  45.9 
 
 		 235 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  45.83 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  42.31 
 
 		 229 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  40.68 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  47.5 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  40.68 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  40.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.71 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>