19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1512 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  77.56 
 
 		 508 aa  811    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  100 
 
 		 505 aa  1033    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  77.36 
 
 		 508 aa  810    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  76.77 
 
 		 508 aa  804    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  68.71 
 
 		 504 aa  726    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  45.29 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  30.63 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  27.97 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  27.66 
 
 		 528 aa  179  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  27.33 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  26.34 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  26.53 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2314  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.643915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  28.38 
 
 		 179 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  25.16 
 
 		 182 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  26.16 
 
 		 197 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  25.53 
 
 		 195 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  24.69 
 
 		 195 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>