More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1411 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  100 
 
 		 313 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  87.5 
 
 		 312 aa  567  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  88.46 
 
 		 312 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  88.14 
 
 		 312 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  76.92 
 
 		 312 aa  497  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0296  thioredoxin-disulfide reductase  79.87 
 
 		 314 aa  500  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1140  thioredoxin-disulfide reductase  76.36 
 
 		 312 aa  461  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 310 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0838  thioredoxin-disulfide reductase  72.52 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  66.35 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.9 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  42.41 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.08 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.68 
 
 		 396 aa  225  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  41.85 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  41.14 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  40.84 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  41.01 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.78 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  39.47 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  39.48 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  39.61 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  40.76 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.17 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.17 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  37.06 
 
 		 318 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.74 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  39.68 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.3 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  39.42 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.59 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  40.38 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  38.19 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.59 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.59 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  40 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  40.31 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  39.62 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  37.06 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.1 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.1 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  39.17 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.1 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.14 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  38.31 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  39.75 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  36.1 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  36.1 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.1 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  39.37 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  36.1 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  39.68 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  40.45 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  40.39 
 
 		 326 aa  208  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  35.46 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  36.1 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  39.49 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  38.14 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  39.49 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  39.49 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  39.24 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  39.49 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  39.05 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  36.66 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  36.1 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  38.99 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  36.98 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  40.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>