225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1392 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  100 
 
 
115 aa  225  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1655  SMR family multidrug efflux pump  77.48 
 
 
112 aa  153  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0677066  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0355  SMR family multidrug efflux pump  79.28 
 
 
112 aa  148  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0332  SMR family multidrug efflux pump  78.38 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.887885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  45.71 
 
 
110 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  45.71 
 
 
110 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  44.76 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  44.76 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  44.76 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  43.81 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  41.75 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  40.78 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  41.58 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  40.59 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  34.58 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.58 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.58 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  34.58 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  35.24 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  34.58 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  33.64 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  37.86 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1183  chaperonin  37.25 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  34.58 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  33.64 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  40 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  40 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2191  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1336  chaperonin  39.81 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  36.36 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  36.36 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  31.73 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  27.27 
 
 
112 aa  59.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
106 aa  59.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  31.07 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  31.07 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  30.77 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0729  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.86 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00310147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0745  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0926  sugE protein, putative  37.86 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0363634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  35.29 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0793  sugE protein  37.86 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000122325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0742  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.86 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00206862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0833  sugE protein  37.86 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000128265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0997  putative sugE protein  37.86 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000051913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  33.96 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0928  putative sugE protein  37.86 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.81419e-47 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  32 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>