74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1384 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  100 
 
 		 273 aa  525  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.78 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  47.72 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  47.72 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  47.72 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  47.96 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  46.31 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  44.83 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  44.83 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  35.07 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  45.45 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  38.65 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  38.5 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  36.32 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  36.32 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  36.53 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  33.18 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  34.83 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  35 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  33.18 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  32.65 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  34.98 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  40.93 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  33.94 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  30.65 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  35.32 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  35.32 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  33.17 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  34.33 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  26.94 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  35.35 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  35.35 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  27.81 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  27.18 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  48.53 
 
 		 193 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  29.41 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.87 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  35.29 
 
 		 193 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  29.09 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.09 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  38.82 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  34.41 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  24.75 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  36.96 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  38.03 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25.43 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  29.55 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  41.03 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  36.49 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1080  abortive infection protein  32.05 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.91 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  41.03 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  25.43 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  28.44 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  32.94 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  31.68 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.14 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  32.26 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0074  Abortive infection protein  32.14 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.460326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.95 
 
 		 337 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 		 337 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>