More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1240 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1240  glycosyltransferase  100 
 
 		 401 aa  801    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000000212379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1242  glycosyltransferase  65.44 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000038464  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1432  galactosyltransferase  56.89 
 
 		 569 aa  354  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000251075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1153  galactosyltransferase  54.94 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00265504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1433  putative sugar transferase  56.38 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000000125132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1244  glycosyltransferase  52.01 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0087282  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0715  galactosyltransferase  41.69 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0718  putative sugar transferase  37.72 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1279  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.71 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.029641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  67.07 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  23.54 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.97 
 
 		 325 aa  99.4  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.18 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  44.92 
 
 		 697 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  48.78 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  46.34 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  48.78 
 
 		 333 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  38.58 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  50.59 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  48.75 
 
 		 1157 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  27.04 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  48.19 
 
 		 1168 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.76 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  51.19 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  45.88 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.47 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  48.19 
 
 		 322 aa  86.7  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  47.56 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  29.17 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  44.71 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  30.57 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  51.81 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  42.35 
 
 		 785 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  48.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  46.25 
 
 		 1148 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.56 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.2 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  47.56 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  48.24 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  43.9 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  47.56 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  47.56 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  43.9 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  48.24 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.62 
 
 		 970 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  51.85 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  25.58 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  42.35 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  42.68 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.06 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  42.68 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  42.68 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.06 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  53.49 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  45.88 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  48.78 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  45.68 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  42.68 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  45.88 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.12 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  43.53 
 
 		 616 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.52 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  48.1 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  48.78 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  45.78 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.12 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  47.67 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  48.24 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  48.19 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  45.24 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  44.19 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>