More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1225 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1225  DNA-binding protein HU  100 
 
 		 100 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.973909999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1731  DNA-binding protein HU  86.6 
 
 		 98 aa  158  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000434632  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  86.6 
 
 		 98 aa  158  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.0000336504  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0901  DNA-binding protein HU  86.6 
 
 		 98 aa  158  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  66.3 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000034735  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0798  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II) (HB)  63.04 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000041032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0021  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II; HB)  62.07 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  56.18 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0967  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  55.68 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  47.19 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.11 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  52.69 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  52.81 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  51.61 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  53.41 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  47.19 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  52.08 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  49.45 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  50.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  48.31 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>