More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1224 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  100 
 
 		 300 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  71.57 
 
 		 299 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  69.9 
 
 		 299 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0920  cysteine synthase A  71.94 
 
 		 253 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222574  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.49 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  52.15 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  52.46 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  49.84 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  52.49 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  50.82 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  48.33 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  48.2 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  48.68 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  48.68 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  49.03 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  45.64 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  48.84 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  45.42 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  48.85 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  49.02 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  47.88 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  46.34 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  48.48 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  49.03 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  46.6 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  48.2 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  50 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  45.27 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  50.17 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  46.36 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47 
 
 		 320 aa  258  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  47.56 
 
 		 308 aa  258  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  45.36 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  46.84 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  45.7 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  44.84 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  46.56 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  46.67 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.71 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 316 aa  254  8e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 302 aa  254  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  48.52 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  49.68 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  46.23 
 
 		 339 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  47.73 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  44.04 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  48.85 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  44.82 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  45.93 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  45.78 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  44.48 
 
 		 305 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  44.48 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  45.15 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  48.18 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  46.1 
 
 		 327 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  44.81 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  47.23 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  45.92 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  46.71 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  46.71 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  44.48 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  46.6 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  43.71 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  47.35 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  49.33 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  48.18 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  45.21 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  43.51 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  46.93 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  42.86 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  43.51 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  49 
 
 		 300 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  42.47 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  45.73 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  46.75 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  45.45 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  46.75 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  42.47 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  46.58 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>