More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1221 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  100 
 
 		 447 aa  890    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  50.55 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  50.77 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  51.27 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  45.47 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  44.07 
 
 		 442 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  36.98 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.36 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  37.41 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  35.49 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  34.35 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.34 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.78 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  37.56 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  35.23 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  37.56 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  33.94 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  35.16 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  33.33 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  35.43 
 
 		 462 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  30.72 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  30.85 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  36.88 
 
 		 470 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  33.84 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  35.31 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.25 
 
 		 480 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  31.3 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  35.04 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  35.88 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  33.5 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.67 
 
 		 480 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.67 
 
 		 480 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.67 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  34.62 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  33.82 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  34.75 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  33.82 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.48 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  31.76 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  34.46 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.6 
 
 		 542 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  33.8 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.64 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  33.33 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.05 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  31.97 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  32.23 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  31.79 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  32.05 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  31.54 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.79 
 
 		 454 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  33.51 
 
 		 449 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31.79 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31.79 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  31.28 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  34.92 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31.54 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  34.92 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  32.53 
 
 		 473 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.82 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  33.08 
 
 		 480 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  33.63 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  31.89 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  33.16 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  35.13 
 
 		 485 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.72 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  33.25 
 
 		 494 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  34.12 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  33.16 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  32.02 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  32.06 
 
 		 478 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  29.76 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.47 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.47 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.47 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  34.96 
 
 		 489 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  32.07 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  31.75 
 
 		 492 aa  199  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  32.27 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  31.77 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  29.54 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  31.39 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  29.27 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  35.13 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  33.96 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  30.39 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  31.73 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  36.52 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  32.55 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  32.74 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  31.23 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  32.6 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  32.6 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  30.75 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3735  MgtE integral membrane region  30.89 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  33.76 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  31.21 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  30.13 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  32.48 
 
 		 492 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>