More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1220 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 		 385 aa  786    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  65.54 
 
 		 386 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  65.54 
 
 		 386 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  64.51 
 
 		 386 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  56.59 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  50.26 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  47.92 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  50 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  47.88 
 
 		 353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  46.25 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.45 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.63 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.63 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  41.47 
 
 		 523 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.43 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.26 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.43 
 
 		 473 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.08 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.63 
 
 		 465 aa  192  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  39.47 
 
 		 470 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  40.76 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.62 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.95 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  32.39 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  42.99 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.34 
 
 		 517 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.35 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  41.35 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  42.53 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.28 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.42 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.52 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.53 
 
 		 471 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  42.19 
 
 		 479 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  32.88 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.54 
 
 		 741 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.78 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.66 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.24 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  33.33 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  34.38 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  40.17 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  31.87 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.5 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  35.58 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.09 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  39.09 
 
 		 464 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.23 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.09 
 
 		 477 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.4 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  36.4 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  38.57 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  32.6 
 
 		 498 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.77 
 
 		 457 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.07 
 
 		 464 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  41.38 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.1 
 
 		 503 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.18 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  28.34 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  35.59 
 
 		 491 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.42 
 
 		 412 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  43.58 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.43 
 
 		 457 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  44.33 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  44.12 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  34.8 
 
 		 453 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.42 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.08 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.59 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.86 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  43.84 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  30.52 
 
 		 569 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  40.59 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  43.84 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.45 
 
 		 513 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  33.92 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  33.92 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.36 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  30.08 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.57 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  39.71 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  30 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.89 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.62 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  39.05 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.78 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  33.77 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.52 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  38.57 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  37.99 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  37.99 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  37.99 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>