245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1198 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  100 
 
 
444 aa  865    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  62.47 
 
 
446 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  62.92 
 
 
446 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  63.15 
 
 
446 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  59.23 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  55.76 
 
 
444 aa  489  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  60.74 
 
 
445 aa  488  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  53.27 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  57.37 
 
 
450 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  54.93 
 
 
444 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  54.48 
 
 
444 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  53.6 
 
 
450 aa  457  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  54.04 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  54.85 
 
 
443 aa  448  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  53.26 
 
 
448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  52.91 
 
 
448 aa  444  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  53.85 
 
 
458 aa  443  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  50.9 
 
 
443 aa  428  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.7 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.44 
 
 
450 aa  273  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.5 
 
 
453 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.99 
 
 
450 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.32 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  35.94 
 
 
486 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  39.41 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.09 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  39.41 
 
 
446 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  266  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  39.64 
 
 
446 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  39.6 
 
 
446 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.94 
 
 
452 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.86 
 
 
464 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.09 
 
 
476 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.46 
 
 
461 aa  260  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.7 
 
 
446 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  36.2 
 
 
452 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 
454 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.03 
 
 
468 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 
452 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.12 
 
 
456 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 
470 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.84 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.17 
 
 
446 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.52 
 
 
486 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.38 
 
 
455 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.32 
 
 
452 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  37.09 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  38.01 
 
 
445 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  38.01 
 
 
445 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  38.24 
 
 
445 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.61 
 
 
464 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 
445 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  38.01 
 
 
445 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.49 
 
 
451 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  38.01 
 
 
445 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.01 
 
 
445 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.68 
 
 
450 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
455 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.93 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.86 
 
 
449 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.57 
 
 
445 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.69 
 
 
466 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.21 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.11 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.84 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  34.84 
 
 
453 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  34.63 
 
 
457 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 
443 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 
453 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  35.75 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
467 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  38.43 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  36.85 
 
 
475 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  38.2 
 
 
452 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  38.65 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  38.65 
 
 
452 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  38.65 
 
 
452 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  38.65 
 
 
451 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  38.65 
 
 
452 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.16 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.23 
 
 
457 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  34.46 
 
 
463 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  32.53 
 
 
478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.52 
 
 
448 aa  216  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  33.86 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 
454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  32.29 
 
 
448 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
452 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.98 
 
 
452 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  31.58 
 
 
448 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.98 
 
 
452 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>