More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1124 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  72.86 
 
 		 270 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  72.86 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  72.12 
 
 		 270 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  58.66 
 
 		 270 aa  304  8.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  58.98 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 		 267 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 		 260 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 497 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  46.46 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 497 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  43.49 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  43.68 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  44.24 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.66 
 
 		 274 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  39.19 
 
 		 510 aa  198  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  44.44 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  44.44 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  44.13 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  44.06 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  41.32 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  42.47 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 490 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  41.27 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  38.26 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  37.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>