13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1108 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  98.59 
 
 		 425 aa  838    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  100 
 
 		 425 aa  853    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  41.59 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  44.05 
 
 		 424 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  42.22 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  40.46 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  38.39 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  40.32 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  36.22 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  32.11 
 
 		 421 aa  156  8e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  31.56 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  30.82 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  24.69 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>