More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1074 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  57.66 
 
 		 642 aa  761    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  57.5 
 
 		 638 aa  742    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  75.47 
 
 		 643 aa  1018    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 644 aa  1316    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  56.46 
 
 		 641 aa  734    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  75.47 
 
 		 643 aa  1018    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  48.62 
 
 		 655 aa  638    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  74.22 
 
 		 643 aa  998    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  56.88 
 
 		 642 aa  752    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  63.07 
 
 		 645 aa  797    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37 
 
 		 618 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.48 
 
 		 646 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.88 
 
 		 640 aa  356  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 640 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.2 
 
 		 751 aa  352  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.21 
 
 		 643 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 		 806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 654 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.67 
 
 		 648 aa  336  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 709 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.47 
 
 		 679 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.7 
 
 		 709 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 709 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 661 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 		 676 aa  332  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  35.12 
 
 		 707 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 		 705 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.83 
 
 		 625 aa  326  7e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.52 
 
 		 693 aa  326  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.6 
 
 		 687 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  35.7 
 
 		 691 aa  323  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.64 
 
 		 714 aa  323  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 795 aa  323  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 		 761 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.71 
 
 		 665 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 714 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 710 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 704 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.42 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 667 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 718 aa  316  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 		 662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  34.18 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 708 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 		 712 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 714 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.05 
 
 		 656 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.81 
 
 		 727 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 		 776 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.37 
 
 		 905 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.09 
 
 		 658 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.23 
 
 		 765 aa  310  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.51 
 
 		 824 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  33.79 
 
 		 757 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 768 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.51 
 
 		 824 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 		 626 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  34.62 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 829 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.75 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 		 712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  34.77 
 
 		 796 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.11 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  34.97 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 755 aa  303  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 		 727 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 727 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.4 
 
 		 648 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  33.95 
 
 		 739 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  35.14 
 
 		 810 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 728 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 724 aa  300  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 770 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  33.05 
 
 		 680 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 718 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  36 
 
 		 827 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 		 734 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.62 
 
 		 727 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  36 
 
 		 827 aa  297  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 		 759 aa  297  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.64 
 
 		 811 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 720 aa  296  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.8 
 
 		 734 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 		 744 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 		 757 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  32.77 
 
 		 681 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  32.92 
 
 		 760 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 710 aa  295  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 775 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>