88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1067 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 97 aa  189  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  70.41 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  70.41 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  68.37 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  57.29 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  57.73 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  58.06 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  49.49 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  59.38 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.36 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.99 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.04 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.18 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.38 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.74 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  35.48 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.57 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.96 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.96 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  37.76 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.42 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.68 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0037  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.36 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  37.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  35.14 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.98 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0171  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.44 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.38 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.16 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.72 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.14 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.91 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.43 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  31.43 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.74 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.82 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.59 
 
 		 106 aa  42  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  30.12 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 103 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 107 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  28.24 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.71 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.73 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  29.79 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.83 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  24.71 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1358  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  29.85 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.44 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  32.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  32.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>