171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1030 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  100 
 
 		 375 aa  766    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  65.69 
 
 		 376 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  64.36 
 
 		 376 aa  524  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  58.24 
 
 		 376 aa  477  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  64.18 
 
 		 335 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  52.65 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.33 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.27 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.57 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.93 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.65 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.16 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.16 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.16 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.84 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.2 
 
 		 354 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.07 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.02 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.84 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  23.78 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  22.42 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  24.15 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  23.3 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.84 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.69 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.37 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.68 
 
 		 336 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  24.93 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.55 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  23.51 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  22.49 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  24.3 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.16 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  23.26 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.81 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  21.39 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  22.29 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  23.66 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  23.05 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  21.63 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  21.63 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  20.74 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.8 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  24.86 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.65 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  20.92 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  21.9 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.52 
 
 		 324 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  22.29 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.2 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  25.41 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  20.07 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.54 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.18 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  18.51 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  18.51 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  27.61 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  21.48 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  22.66 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  18.56 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  22.09 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  24.22 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  23.69 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  23.64 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 		 313 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  21.4 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  23.38 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  23.46 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  23.35 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  23.25 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  24.79 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  22.3 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  23.13 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  23.12 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  22.14 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  20.57 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>