More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0952 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
175 aa  364  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  69.95 
 
 
182 aa  234  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  69.4 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  67.93 
 
 
183 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  54.55 
 
 
188 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  56.91 
 
 
209 aa  191  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  58.29 
 
 
161 aa  191  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  67.61 
 
 
206 aa  191  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  55.06 
 
 
175 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  63.55 
 
 
172 aa  157  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  58.88 
 
 
166 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  37.7 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  35.52 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  43.2 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  42.98 
 
 
142 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  48.11 
 
 
151 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  50.48 
 
 
167 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  47.66 
 
 
151 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  44.86 
 
 
159 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  49.53 
 
 
187 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 
190 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
181 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
184 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  38.17 
 
 
166 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
192 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
192 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
199 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
185 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
179 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  44.44 
 
 
176 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 
196 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  50 
 
 
188 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  50 
 
 
181 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
177 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  49.04 
 
 
181 aa  101  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  47.17 
 
 
156 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  41.51 
 
 
164 aa  101  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  40.68 
 
 
155 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
179 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
182 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  43.27 
 
 
146 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  45.28 
 
 
137 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
186 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
183 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
184 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
184 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  47.66 
 
 
160 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  44.76 
 
 
173 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  46.6 
 
 
156 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  46.6 
 
 
156 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 
178 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  49.06 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  49.06 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  41.35 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  38.6 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  46.73 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  45.79 
 
 
162 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  49.06 
 
 
130 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  42.5 
 
 
154 aa  99  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  42.31 
 
 
149 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.02 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  42.31 
 
 
147 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  42.45 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  48.11 
 
 
130 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  43.81 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  42.86 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  42.45 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  38.28 
 
 
238 aa  97.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  45.79 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  39.13 
 
 
236 aa  97.4  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  47.17 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  35.39 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.59 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  42.06 
 
 
234 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  37.65 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  39.13 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  39.13 
 
 
236 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  37.69 
 
 
231 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  42.34 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  39.13 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>