More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0943 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  88.89 
 
 		 90 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  88.89 
 
 		 90 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  88.89 
 
 		 90 aa  159  8.000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  88.89 
 
 		 90 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  86.67 
 
 		 90 aa  157  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  81.11 
 
 		 90 aa  147  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  77.78 
 
 		 90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  75.56 
 
 		 90 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  57.95 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  59.26 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  58.02 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  57.47 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>