More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0929 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  100 
 
 
506 aa  999    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  72.11 
 
 
508 aa  714    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  70.32 
 
 
508 aa  697    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  61.96 
 
 
514 aa  654    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  71.71 
 
 
508 aa  712    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  63.98 
 
 
516 aa  664    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  61.71 
 
 
512 aa  630  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  49.61 
 
 
535 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  49.8 
 
 
535 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  48.46 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  49 
 
 
522 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  47.88 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  46.44 
 
 
521 aa  435  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  43.48 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  43.59 
 
 
599 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  34.8 
 
 
411 aa  246  6.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  33.4 
 
 
423 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  33.12 
 
 
422 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  33.68 
 
 
422 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  32.7 
 
 
422 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  31.81 
 
 
504 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  32.63 
 
 
418 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  30.32 
 
 
429 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  31.2 
 
 
411 aa  193  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  31.59 
 
 
461 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  33.33 
 
 
549 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  46.7 
 
 
422 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  45.25 
 
 
423 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  45.05 
 
 
422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  50.3 
 
 
423 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  43.78 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  47.09 
 
 
428 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  35.85 
 
 
419 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  43.58 
 
 
523 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  46.67 
 
 
420 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  45.61 
 
 
419 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  44.51 
 
 
422 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  44.15 
 
 
424 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  46.11 
 
 
423 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  48.02 
 
 
422 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  45.3 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  44.86 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  48.5 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  36.55 
 
 
401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  47.19 
 
 
421 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  44.31 
 
 
417 aa  140  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  43.01 
 
 
429 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  44.31 
 
 
417 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  43.01 
 
 
429 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  43.01 
 
 
429 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  43.01 
 
 
429 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  44.2 
 
 
422 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  41.8 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  26.16 
 
 
520 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  45.98 
 
 
422 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  29.91 
 
 
596 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  42.02 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  43.75 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  42.61 
 
 
411 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  42.02 
 
 
429 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  42.02 
 
 
429 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  27.27 
 
 
580 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  47.27 
 
 
501 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  40.88 
 
 
426 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  40.1 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  31.03 
 
 
494 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  43.83 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  41.81 
 
 
397 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  32.57 
 
 
514 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  43.11 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  40.5 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  42.17 
 
 
402 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  30.08 
 
 
505 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  31.79 
 
 
571 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  46.07 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  43.79 
 
 
497 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  30.08 
 
 
505 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  39.66 
 
 
582 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  34.16 
 
 
521 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  43.03 
 
 
500 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  35.84 
 
 
558 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  35.86 
 
 
502 aa  120  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  35.64 
 
 
498 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  31 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  30.12 
 
 
494 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  35.71 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  35.71 
 
 
417 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  41.34 
 
 
416 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  37.07 
 
 
332 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  37.07 
 
 
332 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3837  phosphate transporter family protein  36.63 
 
 
332 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0211808  hitchhiker  0.000000000133014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  31.53 
 
 
332 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  35.78 
 
 
332 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  38.92 
 
 
332 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  44.67 
 
 
499 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>