250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0902 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  100 
 
 		 469 aa  961    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  60.04 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  60.04 
 
 		 470 aa  568  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  59.62 
 
 		 470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  59.04 
 
 		 580 aa  559  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  56.3 
 
 		 487 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  55.04 
 
 		 476 aa  524  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  53.4 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  48.33 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  49.27 
 
 		 498 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  46.2 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  35.73 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  37.93 
 
 		 522 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  38.41 
 
 		 487 aa  292  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  37.34 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  36.53 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  37.45 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  34.48 
 
 		 494 aa  276  8e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  37.86 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  35.21 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  37.06 
 
 		 497 aa  266  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  34 
 
 		 499 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  37.08 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  32.07 
 
 		 498 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  33.87 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  35.94 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  34.66 
 
 		 499 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  36.41 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  36.41 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  37.16 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  38.17 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  34.89 
 
 		 490 aa  255  9e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  35.53 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.91 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  35.05 
 
 		 461 aa  253  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  34.52 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  35.53 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  34.29 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  35.57 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  34.51 
 
 		 471 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  34.81 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  34.51 
 
 		 474 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  34.62 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  34.05 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  34.95 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  34.89 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  31.91 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  33.57 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  31.71 
 
 		 470 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  32.78 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  34.03 
 
 		 470 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  33.64 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  32.62 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.57 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  33.02 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  32.88 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  31.56 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  32.94 
 
 		 465 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  34.35 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  31.69 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  30.04 
 
 		 471 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.55 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  30.1 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  31.74 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  35.66 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  35.66 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  31.1 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  33.79 
 
 		 469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  33.26 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  32.47 
 
 		 473 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  33.26 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  33.72 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  33.72 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  33.95 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  33.72 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.18 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  33.64 
 
 		 469 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  34.03 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  33.95 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  33.72 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  35.27 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  32.8 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  31.39 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  33.96 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  30.52 
 
 		 466 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  29.88 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  32.49 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  33.8 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  32.25 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  29.06 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  29.96 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  28.49 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  34.25 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  29.67 
 
 		 547 aa  219  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  31.65 
 
 		 461 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  31.54 
 
 		 465 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  31.66 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  31.41 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  32.48 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  31.02 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>