More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0890 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  100 
 
 		 275 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  52.43 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  52.42 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  48.38 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  45.25 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  45.35 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 272 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  44.03 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  42.54 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  41.22 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  45.63 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.33 
 
 		 273 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 416 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  41.79 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 416 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 416 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  41.42 
 
 		 416 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  43.61 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  40.65 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  43.68 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  46.31 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  41.57 
 
 		 289 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  41.57 
 
 		 289 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  40.82 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  41.61 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  40.82 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  42.41 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  44.35 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  42.26 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  41.22 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  37.17 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  30.71 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  27.31 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.43 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  32.77 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  26.59 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  24.71 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  26.15 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  28.47 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  24.9 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  28.8 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  23.79 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  23.91 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  25.72 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.78 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  26.46 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  26.86 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  27.12 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  28.11 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  31.43 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 		 583 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  25.68 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  28.17 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  26.23 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  29.67 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  27.12 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.23 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  28.65 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  26.56 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  27.27 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  28.16 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  26.63 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  28.89 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  27.49 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  32.14 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  28.18 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  28.76 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  28.76 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  26.55 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  24.57 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  26.51 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  23.42 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  26.51 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  28.26 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  22.91 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  27.91 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  27.01 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  27.31 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  27.78 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  22.55 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  25.95 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  22.68 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  25.71 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  23.74 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  28.74 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  28.4 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  26.9 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>