42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0872 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  48.46 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  46.46 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  29.43 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.98 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  26.17 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  25.09 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.73 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  32.43 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  25.94 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.48 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  23.18 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  21.99 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.29 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  25.64 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  25.64 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  25.64 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.36 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  20.06 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.08 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.19 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.71 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  26.22 
 
 		 228 aa  49.3  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.5 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.53 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  20.99 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.52 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  21.81 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  31.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  26.41 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  54.29 
 
 		 696 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  22.27 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  22.33 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  20.58 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.78 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  21.28 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2762  transcriptional regulator-like protein  26.03 
 
 		 445 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.04 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4069  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.26 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>