More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0791 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  72.76 
 
 		 247 aa  360  8e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  72.36 
 
 		 247 aa  359  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  72.24 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  63.88 
 
 		 262 aa  344  7e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  61.62 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  67.53 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  58.45 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  57.71 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  59.02 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  51.31 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  56.08 
 
 		 264 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  56.38 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  56.35 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  56.18 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  59.02 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  59.02 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  54.88 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  52.59 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  54.18 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  61.19 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  59.35 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  50.92 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  54.58 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  50.55 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  50.18 
 
 		 281 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  49.1 
 
 		 285 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  50.21 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  50.84 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  55.71 
 
 		 296 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  50.2 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  50.41 
 
 		 283 aa  234  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  51.05 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  46.31 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  48.32 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.55 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.3 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  48.62 
 
 		 394 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  46.79 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  46.98 
 
 		 292 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  46.03 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  50.96 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  49.54 
 
 		 407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  46.22 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  47.16 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  41.76 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  41.76 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.35 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  45.45 
 
 		 300 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.91 
 
 		 290 aa  208  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 267 aa  208  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  47.87 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  47.69 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  47.87 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  47.03 
 
 		 313 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  46.78 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  45.64 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  47.17 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  47.39 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  46.58 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.91 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  45.26 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.91 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.91 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.91 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45 
 
 		 352 aa  205  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 307 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.66 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  43.35 
 
 		 326 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 		 273 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 276 aa  204  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 282 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  39.64 
 
 		 323 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 303 aa  204  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  43.66 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  50.47 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  49.75 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  43.46 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  41.7 
 
 		 281 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  40.93 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.48 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  48.75 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  50.25 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  43.57 
 
 		 313 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  45.33 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 303 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>