More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0779 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  100 
 
 
472 aa  936    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  63.85 
 
 
472 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  63.64 
 
 
472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  63.64 
 
 
472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  56.33 
 
 
468 aa  488  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  56.21 
 
 
471 aa  488  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  55.06 
 
 
467 aa  484  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  54.47 
 
 
472 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  55.32 
 
 
471 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  48.73 
 
 
461 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.7 
 
 
513 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  41.82 
 
 
471 aa  309  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  40.28 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.22 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.67 
 
 
511 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.28 
 
 
502 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.81 
 
 
460 aa  299  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  41.63 
 
 
462 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.27 
 
 
476 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.66 
 
 
412 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.7 
 
 
451 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.2 
 
 
383 aa  292  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.75 
 
 
453 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  36.73 
 
 
463 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.66 
 
 
502 aa  289  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.9 
 
 
458 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.71 
 
 
396 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.81 
 
 
449 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.45 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.15 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.15 
 
 
450 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.15 
 
 
450 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.91 
 
 
505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  45.71 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.17 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  45.71 
 
 
389 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  36.57 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.55 
 
 
451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  38.74 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.22 
 
 
506 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  44.21 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  37.59 
 
 
467 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.74 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.74 
 
 
450 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.74 
 
 
450 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.91 
 
 
500 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.09 
 
 
450 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.71 
 
 
457 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  42 
 
 
458 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.01 
 
 
504 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  36.67 
 
 
467 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  42.54 
 
 
386 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  36.21 
 
 
474 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  40.38 
 
 
450 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  36.21 
 
 
474 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  40.57 
 
 
449 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.16 
 
 
478 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  37.53 
 
 
467 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  43.32 
 
 
456 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  35.87 
 
 
468 aa  279  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.7 
 
 
455 aa  279  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  40 
 
 
459 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.49 
 
 
476 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  40.88 
 
 
463 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  42.11 
 
 
386 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  36.36 
 
 
464 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.18 
 
 
473 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  40.88 
 
 
457 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  35.38 
 
 
464 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  40.88 
 
 
457 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  37.94 
 
 
450 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.18 
 
 
383 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  39.07 
 
 
450 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  36.7 
 
 
492 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.94 
 
 
380 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  46.11 
 
 
407 aa  276  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  41.27 
 
 
386 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  41.36 
 
 
456 aa  275  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  41.27 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.09 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  43.45 
 
 
386 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  46.11 
 
 
387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.73 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.74 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.95 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  37 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  42.9 
 
 
385 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.74 
 
 
455 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.3 
 
 
380 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.11 
 
 
398 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  43.18 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  46.11 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.98 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  46.11 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.42 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  45.79 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  46.11 
 
 
402 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.42 
 
 
401 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.42 
 
 
401 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>