More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0778 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  100 
 
 
288 aa  577  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  68.94 
 
 
294 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  67.23 
 
 
297 aa  353  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  67.23 
 
 
297 aa  353  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  67.59 
 
 
290 aa  349  4e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  62.29 
 
 
296 aa  347  9e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  63.51 
 
 
295 aa  345  3e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  63.3 
 
 
298 aa  328  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1382  heat shock protein DnaJ domain protein  60.14 
 
 
297 aa  311  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.995337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0554  heat shock protein DnaJ-like  54.48 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.8 
 
 
326 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.49 
 
 
294 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  37.93 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  34.12 
 
 
287 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.65 
 
 
291 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.12 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.19 
 
 
301 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  33.33 
 
 
315 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  34.97 
 
 
299 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35 
 
 
325 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.31 
 
 
335 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.52 
 
 
289 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.08 
 
 
325 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  32.37 
 
 
318 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  34.15 
 
 
311 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.44 
 
 
339 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  32.66 
 
 
318 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  36.21 
 
 
308 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  33.22 
 
 
311 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.57 
 
 
315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.45 
 
 
339 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  32.67 
 
 
297 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  34.97 
 
 
316 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.66 
 
 
324 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  34.45 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  34.12 
 
 
309 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  32.26 
 
 
318 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  31.21 
 
 
320 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  31.19 
 
 
313 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  35.43 
 
 
307 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  34.18 
 
 
330 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  32.53 
 
 
313 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  35.52 
 
 
319 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.79 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  34.89 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  34.36 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  33.45 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  34.55 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  30.77 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  30.77 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.52 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  32.42 
 
 
313 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  35.93 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  34.46 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.97 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  33 
 
 
321 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  32.2 
 
 
375 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  34.16 
 
 
330 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  29.75 
 
 
335 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  33.45 
 
 
314 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  33.55 
 
 
304 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  33.56 
 
 
309 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  33.33 
 
 
332 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  32.67 
 
 
323 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  33.45 
 
 
302 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.06 
 
 
314 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.46 
 
 
325 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.06 
 
 
330 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.11 
 
 
317 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  30.03 
 
 
320 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  35 
 
 
318 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  36.11 
 
 
340 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  30.98 
 
 
297 aa  142  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  33.67 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.42 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  33.22 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  32.34 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.19 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.55 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  31.17 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  32.28 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  33.11 
 
 
333 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  33.77 
 
 
333 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  30.98 
 
 
326 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  31.58 
 
 
319 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  34.39 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  34.34 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  31.33 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  30.95 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  31.85 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  31.23 
 
 
306 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  29.71 
 
 
319 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.65 
 
 
313 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  35.31 
 
 
314 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.04 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.8 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  32.87 
 
 
304 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>