More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0694 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  100 
 
 
407 aa  805    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  68.98 
 
 
415 aa  557  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  68.73 
 
 
415 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  43.61 
 
 
431 aa  316  6e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  43.57 
 
 
429 aa  310  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  41.84 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  41.58 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  41.84 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  40 
 
 
432 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  41.84 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  38.46 
 
 
438 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  38.46 
 
 
438 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  39.53 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  39.27 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  39.27 
 
 
429 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  39.21 
 
 
429 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  38.96 
 
 
462 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  38.96 
 
 
466 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  37.93 
 
 
445 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  37.35 
 
 
429 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  38.31 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  38.96 
 
 
459 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  37.82 
 
 
435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  37.19 
 
 
436 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  37.6 
 
 
433 aa  279  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  38.54 
 
 
436 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  36.92 
 
 
435 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  40.31 
 
 
442 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  37.63 
 
 
435 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
445 aa  275  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  38.74 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  38.74 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  36.67 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  36.71 
 
 
435 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  36.96 
 
 
436 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  36.71 
 
 
461 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  39.11 
 
 
448 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  37.18 
 
 
436 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  36.46 
 
 
458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  36.46 
 
 
458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  39.53 
 
 
487 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  36.34 
 
 
466 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
437 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  36.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  36.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 
433 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  36.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
445 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  36.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  36.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
447 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.84 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
445 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  36.5 
 
 
465 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  39.16 
 
 
432 aa  256  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  39.31 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  36.39 
 
 
441 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  36.27 
 
 
442 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  36.27 
 
 
442 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  38.52 
 
 
438 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  39.34 
 
 
441 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  37.47 
 
 
450 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  38.89 
 
 
441 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  38.61 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  36.43 
 
 
438 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  36.18 
 
 
443 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  35.43 
 
 
387 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  38.23 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  28.46 
 
 
444 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  30.26 
 
 
461 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  31.02 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  30.81 
 
 
425 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  31.22 
 
 
435 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  27.99 
 
 
444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  30.02 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  30.02 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.84 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  30.02 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  30.64 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  27.74 
 
 
444 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  30.53 
 
 
425 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  28.64 
 
 
444 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  29.16 
 
 
435 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  30.53 
 
 
431 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  28.88 
 
 
435 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  30.52 
 
 
436 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  31.52 
 
 
425 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  31.52 
 
 
425 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  30.7 
 
 
425 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  31.52 
 
 
425 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  30.5 
 
 
434 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  31.87 
 
 
425 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
434 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  30.77 
 
 
425 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  28.3 
 
 
458 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  30.64 
 
 
436 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
425 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>