216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0576 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 398 aa  788    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  60.61 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  60.86 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  60.35 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  51.41 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  51.41 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  50.38 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  30.05 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  30.3 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 443 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 447 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.26 
 
 		 520 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  26.7 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  26.7 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 429 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  29.57 
 
 		 429 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  29.73 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 476 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 474 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.88 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  25.85 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.85 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  26.29 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  24.38 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.38 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 713 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  24.74 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  23.89 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.72 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  25.07 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  24.92 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  24.32 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 		 426 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  24.42 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 726 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  22.88 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  23.01 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>