More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0451 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  99.21 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  99.21 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  99.21 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  98.37 
 
 		 124 aa  246  6e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  96.06 
 
 		 127 aa  244  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  93.55 
 
 		 125 aa  236  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 126 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0186  30S ribosomal protein S12  96.61 
 
 		 132 aa  230  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00248726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  84 
 
 		 125 aa  218  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  217  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  216  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  84.8 
 
 		 125 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  83.2 
 
 		 125 aa  215  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  82.54 
 
 		 126 aa  214  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  214  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 126 aa  213  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 126 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 125 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 125 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 125 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  80.95 
 
 		 126 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 125 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 125 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 125 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 125 aa  209  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  77.95 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  82.4 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5084  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000372419  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 142 aa  207  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  207  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  207  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0449  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245069  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 135 aa  206  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0482  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00887343  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0479  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  80.31 
 
 		 127 aa  204  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  76.38 
 
 		 127 aa  204  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  203  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  82.68 
 
 		 127 aa  203  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>