More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0383 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  62.69 
 
 		 540 aa  660    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  59.88 
 
 		 659 aa  798    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  55.42 
 
 		 651 aa  676    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  65.13 
 
 		 678 aa  804    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  60.74 
 
 		 660 aa  690    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  61.5 
 
 		 658 aa  698    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 		 656 aa  1328    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  72.63 
 
 		 657 aa  954    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  60.18 
 
 		 659 aa  797    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  51.05 
 
 		 653 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  49.12 
 
 		 665 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  47.93 
 
 		 662 aa  538  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  51.27 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  51.08 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  51.28 
 
 		 731 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  50.49 
 
 		 700 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  46.31 
 
 		 653 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  38.93 
 
 		 652 aa  423  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  43.46 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  44.42 
 
 		 657 aa  412  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  35.95 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  36.5 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  36.5 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  51.07 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 649 aa  363  6e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  55.49 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  55.49 
 
 		 544 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  77.12 
 
 		 236 aa  356  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  35.89 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  40.78 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  49.42 
 
 		 651 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  38.95 
 
 		 604 aa  309  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  45.58 
 
 		 656 aa  300  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 663 aa  243  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  42.12 
 
 		 553 aa  229  9e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1548  methyl-accepting chemotaxis protein  32.67 
 
 		 293 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00384981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 633 aa  164  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 		 625 aa  160  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  29.41 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  26.76 
 
 		 626 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 		 713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.67 
 
 		 832 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.24 
 
 		 630 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  27.92 
 
 		 624 aa  134  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  25.04 
 
 		 627 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  28.22 
 
 		 671 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.76 
 
 		 609 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0855945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.54 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  24.2 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 669 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.79 
 
 		 778 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  43.89 
 
 		 661 aa  126  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 702 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 665 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.76 
 
 		 658 aa  123  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  47.53 
 
 		 431 aa  123  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.23 
 
 		 632 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  26.25 
 
 		 650 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.7 
 
 		 796 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 		 682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3105  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 767 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 		 675 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 560 aa  122  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 		 616 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 		 656 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 		 782 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 548 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.84 
 
 		 647 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 		 563 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 		 659 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 633 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 609 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 		 599 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.13 
 
 		 606 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0151  methyl-accepting chemotaxis protein  31.15 
 
 		 678 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  50 
 
 		 656 aa  120  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 		 563 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  23.71 
 
 		 627 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.59 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.12 
 
 		 626 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  58.49 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.99 
 
 		 888 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>