48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0381 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1566    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  46.2 
 
 		 788 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  46.08 
 
 		 788 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  46.08 
 
 		 788 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  39.64 
 
 		 783 aa  482  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  37.97 
 
 		 786 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  38.15 
 
 		 781 aa  464  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  36.55 
 
 		 803 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  31.7 
 
 		 780 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  31.77 
 
 		 781 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.38 
 
 		 951 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.16 
 
 		 911 aa  84.3  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  21.91 
 
 		 984 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1100 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  23.38 
 
 		 988 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1039 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1000 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  20.89 
 
 		 976 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  22.61 
 
 		 968 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.99 
 
 		 919 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.71 
 
 		 1048 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1049 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  20.42 
 
 		 960 aa  59.3  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  22.75 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  22.86 
 
 		 1047 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  25 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1053 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1048 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  23.05 
 
 		 1049 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  19.67 
 
 		 1037 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  20.29 
 
 		 1040 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  21.33 
 
 		 1045 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  22.88 
 
 		 1000 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  20.38 
 
 		 1001 aa  52  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.95 
 
 		 916 aa  52.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1042 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  19.13 
 
 		 947 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  19.54 
 
 		 962 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  18.4 
 
 		 957 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  26.63 
 
 		 1149 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  21.03 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  24.26 
 
 		 977 aa  48.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  23.23 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  23.23 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  23.4 
 
 		 922 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  22.61 
 
 		 997 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  21.84 
 
 		 997 aa  44.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  28.86 
 
 		 244 aa  44.3  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>