17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0370 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  59.3 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  59.3 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  59.06 
 
 		 172 aa  203  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  41.32 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  39.39 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  40.37 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  35.22 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  36.9 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  32.11 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  31.07 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  27.07 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  33.66 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  33.33 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  20.81 
 
 		 205 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  27.34 
 
 		 325 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  32 
 
 		 452 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>