86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0361 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  66.15 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  66.15 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  65.62 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  46.32 
 
 		 200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  42.57 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  44.9 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  41.27 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  36.92 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  35.05 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.76 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.02 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  37.11 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  34.83 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  35.38 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  35.38 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  32.64 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  32.64 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  37.11 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  31.51 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  31.77 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  32.14 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  29.38 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  28.91 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  31.18 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  27.55 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  27.09 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  25.89 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  26.83 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  28.71 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  29.57 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  29.38 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  26.54 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  29.45 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  29.21 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.88 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  30.93 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  27.05 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.81 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  25.5 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  31.86 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  39.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  35.45 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  43.28 
 
 		 74 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  40.68 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  49.3  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  37.04 
 
 		 72 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  33.9 
 
 		 72 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  26.25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  26.39 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.48 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  29.63 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  25 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  26.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  26.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.77 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  26.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  26.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  30.3 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.17 
 
 		 75 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  31.48 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.88 
 
 		 68 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  42.11 
 
 		 69 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  33.33 
 
 		 71 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  34.09 
 
 		 75 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  34.09 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  34.09 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  36.17 
 
 		 75 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  34.09 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  30.77 
 
 		 71 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  38.78 
 
 		 79 aa  41.6  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  38.78 
 
 		 79 aa  41.6  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  40.91 
 
 		 72 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  31.91 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  31.91 
 
 		 75 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>