64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0314 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  71.12 
 
 		 779 aa  1128    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  70.47 
 
 		 779 aa  1123    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1576    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  41.94 
 
 		 771 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  46.14 
 
 		 754 aa  622  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  41.93 
 
 		 693 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1022 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  36.03 
 
 		 990 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  33.78 
 
 		 795 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  36.07 
 
 		 815 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  33.03 
 
 		 814 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  34.31 
 
 		 358 aa  224  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  32.14 
 
 		 389 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  31.62 
 
 		 396 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  31.79 
 
 		 414 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.01 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.11 
 
 		 975 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  23.33 
 
 		 874 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.46 
 
 		 971 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.08 
 
 		 884 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  25.91 
 
 		 956 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.46 
 
 		 971 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  24.16 
 
 		 870 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14450  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.74 
 
 		 572 aa  49.3  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  20.12 
 
 		 821 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  30.51 
 
 		 842 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  23.37 
 
 		 866 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  31.58 
 
 		 971 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  30.37 
 
 		 868 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.43 
 
 		 873 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32 
 
 		 950 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  50 
 
 		 1115 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.58 
 
 		 887 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.1 
 
 		 811 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  23.08 
 
 		 1240 aa  46.6  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 869 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  40.58 
 
 		 797 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 868 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  31.58 
 
 		 803 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 868 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.18 
 
 		 889 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.57 
 
 		 592 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  23.23 
 
 		 963 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  22.12 
 
 		 791 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  24.34 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 869 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  27.21 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  28.26 
 
 		 911 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  27.21 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 793 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 792 aa  45.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  28 
 
 		 814 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0821  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  26.67 
 
 		 956 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.5 
 
 		 959 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 		 868 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 792 aa  45.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  23.16 
 
 		 828 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  21.75 
 
 		 907 aa  44.3  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 792 aa  44.3  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3993  PEP-utilising protein mobile region  44.07 
 
 		 761 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.800573  normal  0.608484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 792 aa  44.3  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1734  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  42.31 
 
 		 543 aa  44.3  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>