More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0304 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  80.38 
 
 		 212 aa  356  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  63.41 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  63.11 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  64.25 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  55.88 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  59.8 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  33.89 
 
 		 396 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 456 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.69 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0340  HAD superfamily hydrolase  29.5 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.369886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  26.84 
 
 		 456 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.14 
 
 		 456 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.61 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  26.4 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  26.97 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.88 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.32 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  30.16 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.26 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  28.72 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  27 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 728 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.29 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  27 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.51 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.51 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.28 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.27 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.98 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.67 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  25.39 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  27.09 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.26 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.44 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 707 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  24.17 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  26.46 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 707 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  27.22 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  27.41 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3640  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.68 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.72 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.8 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.8 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  30 
 
 		 714 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.32 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  26.53 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.23 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  24.23 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  26.89 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  27.23 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.95 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  26.76 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  24.11 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  26.18 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  29.02 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.74 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>