170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0281 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  77.8 
 
 		 446 aa  723    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 446 aa  908    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  78.92 
 
 		 446 aa  732    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  63.96 
 
 		 449 aa  595  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  32.89 
 
 		 481 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  33.41 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  33.18 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.54 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.45 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.44 
 
 		 461 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.54 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.11 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.89 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.25 
 
 		 460 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.89 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.75 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  30.46 
 
 		 465 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.51 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.97 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.47 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  29.6 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.84 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.23 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  29.66 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  28.85 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.32 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  32.06 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  29.71 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  28.83 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  29.37 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 		 458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  29.08 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.65 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.51 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  28.67 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  28.27 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.78 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  27.41 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.6 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  26.11 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  24.56 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  28.76 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.05 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  26.7 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  24.27 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  26.04 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  28.81 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  25.68 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.78 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.79 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.86 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  26.04 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.01 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  25.84 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.33 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  27.72 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  24.78 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  24.78 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.13 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  25.11 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  26.43 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  24.28 
 
 		 504 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  27.31 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  26.55 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  21.71 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  25.12 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  25.23 
 
 		 453 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  27.14 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  27.62 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  28.09 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  27.27 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>