More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0229 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  100 
 
 
407 aa  819    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0077  chlorohydrolase  64.15 
 
 
409 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0105  chlorohydrolase  64.22 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0064  chlorohydrolase  63.48 
 
 
409 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  53.09 
 
 
407 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  52.22 
 
 
406 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  44.09 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0362  chlorohydrolase  42.96 
 
 
404 aa  355  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  44.23 
 
 
405 aa  336  5e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  40.2 
 
 
408 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  29.4 
 
 
422 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  28.85 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  27.63 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  27.52 
 
 
415 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  27.75 
 
 
422 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  27.57 
 
 
299 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  25.36 
 
 
421 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  24.55 
 
 
416 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  24.68 
 
 
440 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  28.11 
 
 
414 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  28.99 
 
 
414 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  26.49 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  27.78 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  24.03 
 
 
442 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  25.45 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  23.06 
 
 
452 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.06 
 
 
660 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  22.77 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  24.67 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.7 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.88 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  24.93 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  27.18 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.3 
 
 
431 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.06 
 
 
431 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  24.55 
 
 
447 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  21.2 
 
 
451 aa  92.8  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.82 
 
 
434 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  23.1 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  24.57 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.01 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  26.21 
 
 
398 aa  89.7  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  26.13 
 
 
428 aa  89.7  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  24.23 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  22.86 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  23.97 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  20.77 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  26.1 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1737  amidohydrolase  25.89 
 
 
411 aa  87  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  22.86 
 
 
435 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  22.86 
 
 
435 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  25.86 
 
 
466 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  22.86 
 
 
435 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  22.86 
 
 
441 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  22.86 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  22.8 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  22.62 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  22.62 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  22.62 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  22.62 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  22.89 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  25.6 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  23.46 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2026  amidohydrolase  24.31 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.761901  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.6 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  24.77 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  24.09 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  24.86 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  22.44 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  24.86 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.26 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  23.41 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.26 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  25.63 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.26 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  23.53 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  20.66 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  23.81 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.04 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.76 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  26.72 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  25.69 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.67 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.67 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  23.19 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.01 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.01 
 
 
500 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  26.73 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  22.92 
 
 
656 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  30.06 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  22.49 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.01 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  21.81 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.71 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.51 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  23.33 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  26.46 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.97 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.49 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0252  amidohydrolase  22.68 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.99632  normal  0.114468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>