More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0198 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  77.17 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  77.17 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  76.38 
 
 		 129 aa  203  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  52.38 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  53.17 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  51.61 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  53.17 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.23 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.8 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  37.4 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  36.59 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  38.02 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  34.92 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  38.02 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  34.92 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  35.77 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  38.84 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  34.71 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  36.36 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  37.19 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.4 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  34.71 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  36.59 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  34.92 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  33.61 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  37.1 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  36.44 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  35.77 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  36.44 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  33.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  36.44 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  34.15 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  34.96 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  34.15 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  34.43 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  30.08 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  35.54 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  35.48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  36.07 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  37.29 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  33.33 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  33.33 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  33.33 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  36.44 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  35.48 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  35.54 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  34.68 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  36.44 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  36.44 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0726  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  32.28 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  34.68 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  34.68 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  34.68 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  30.89 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  34.75 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  34.68 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  34.68 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  32.28 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  33.87 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  33.06 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.25 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  32.52 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  32 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  33.88 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  32.52 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.9 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1309  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  32.23 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  33.59 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>