68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0192 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 173 aa  331  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.91 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.91 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.76 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.16 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.89 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.91 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.2 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  36.93 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  23.26 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.53 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  26.32 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.82 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.82 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  27.66 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.63 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.82 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  23.24 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0144  ATP synthase F1, delta subunit  26.06 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.000353318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.49 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.82 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.09 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.41 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.67 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.12 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0293  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.7 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.19 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  18.44 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  25.55 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.55 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 178 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 178 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 		 180 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 178 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  29.23 
 
 		 175 aa  42  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  19.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.98 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  26.81 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.36 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  25.18 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  23.02 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  25.37 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>