More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0186 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  73.36 
 
 
305 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  73.03 
 
 
305 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  72.7 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 
301 aa  360  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  53.82 
 
 
301 aa  334  9e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  53.97 
 
 
304 aa  316  3e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
319 aa  315  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  55.33 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 
302 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 
312 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
313 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
316 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 
322 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 
359 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.75 
 
 
315 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
318 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
318 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  33.98 
 
 
311 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 
319 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
318 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 
323 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  35.76 
 
 
314 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
318 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 
312 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
311 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
313 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
319 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 
312 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
315 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  35.86 
 
 
307 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 
318 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 
318 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  35.43 
 
 
315 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.3 
 
 
318 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  36.42 
 
 
315 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
314 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
314 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
318 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 
308 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  34.94 
 
 
314 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
320 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
313 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
318 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  34.62 
 
 
314 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  36.07 
 
 
317 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
310 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 
309 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
317 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 
308 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 
320 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
329 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 
309 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  34.5 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  33 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  34.87 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  33.75 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
317 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  33.76 
 
 
318 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  35.43 
 
 
310 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 
313 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
307 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  35.43 
 
 
316 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
314 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 
315 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 
311 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  34.62 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>