More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0184 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 		 84 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 		 84 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 		 84 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  97.62 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  96.43 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  94.05 
 
 		 85 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 		 85 aa  156  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 85 aa  133  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 92 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  71.95 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>