112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0159 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
392 aa  774    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  65.31 
 
 
391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.29 
 
 
391 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.29 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  48.32 
 
 
389 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  49.59 
 
 
387 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  49.2 
 
 
388 aa  362  6e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.23 
 
 
387 aa  348  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  47.27 
 
 
387 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 
392 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
382 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
614 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
614 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 
389 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  27.9 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
611 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.46 
 
 
614 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.44 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.44 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.44 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.18 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  27.18 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  27.18 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.18 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.18 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.37 
 
 
608 aa  79.7  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.91 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  23.79 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
719 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.35 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  22.8 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  22.8 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  22.8 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  22.8 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  22.87 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  22.87 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  22.87 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  22.53 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  22.65 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  24.27 
 
 
484 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  22.53 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.47 
 
 
484 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  23.32 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.09 
 
 
375 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  21.37 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  27.41 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.19 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 
573 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  23.61 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.25 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
412 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  23.72 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.91 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.91 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.91 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.91 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.91 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 
485 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  22.45 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  24.14 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  25 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.58 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.42 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 
715 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  25 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  20.47 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
750 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.41 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.14 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.9 
 
 
399 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.57 
 
 
589 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.93 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.03 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  22.4 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  22.51 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  21.77 
 
 
777 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  20.4 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 
530 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>