More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0131 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
342 aa  695    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  55.26 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  55.26 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  54.68 
 
 
339 aa  358  9e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  32.58 
 
 
353 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  31.76 
 
 
330 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.32 
 
 
386 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.88 
 
 
375 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  34.09 
 
 
350 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.23 
 
 
357 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.34 
 
 
357 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  37.35 
 
 
384 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  29.18 
 
 
353 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  34.38 
 
 
324 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 
363 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  32.32 
 
 
373 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
362 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 
381 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  34.77 
 
 
366 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.67 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  34.66 
 
 
388 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  27.73 
 
 
360 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  35.66 
 
 
358 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  31.78 
 
 
363 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.27 
 
 
354 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.29 
 
 
357 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  35.66 
 
 
358 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.23 
 
 
350 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.27 
 
 
354 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.68 
 
 
372 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  31.56 
 
 
464 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  35.27 
 
 
353 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  34.06 
 
 
355 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  30.89 
 
 
381 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.53 
 
 
363 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  34.11 
 
 
365 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  30.75 
 
 
355 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.68 
 
 
372 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  31.58 
 
 
365 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  30.06 
 
 
350 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.37 
 
 
372 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  31.25 
 
 
362 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 
350 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.59 
 
 
368 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  34.45 
 
 
365 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  32.86 
 
 
353 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  30.08 
 
 
354 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  29.6 
 
 
368 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  31.15 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  30.46 
 
 
355 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  36.07 
 
 
364 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  33.23 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  30.03 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.38 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.49 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  33.78 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  33.78 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  31.15 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  29.66 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  30.56 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  29.76 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  31.38 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  31.46 
 
 
363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  29.46 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.81 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.4 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  31.45 
 
 
354 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  32.62 
 
 
369 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  29.61 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  32.59 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.81 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.95 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  31.38 
 
 
355 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  29.32 
 
 
370 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  30.34 
 
 
371 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
362 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  30.34 
 
 
372 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  30.34 
 
 
419 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
357 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  34.55 
 
 
370 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  32.85 
 
 
362 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  30.89 
 
 
434 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  29.79 
 
 
368 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  39.82 
 
 
383 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
386 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.08 
 
 
367 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  28.86 
 
 
382 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  33.84 
 
 
360 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
376 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>