More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0127 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 435 aa  854    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  43.65 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  33.56 
 
 		 389 aa  195  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  41.73 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  40.59 
 
 		 371 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  37.23 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  38.91 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  38.87 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  35.56 
 
 		 331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  35.2 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  33.73 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  34.13 
 
 		 281 aa  113  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  34.26 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  33.96 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  34.16 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  26.86 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  31.62 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 457 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  34.12 
 
 		 497 aa  98.2  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  26.14 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  26.14 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  32.34 
 
 		 256 aa  97.1  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  26.44 
 
 		 443 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  27.56 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.41 
 
 		 599 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 351 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  33.96 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 253 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 351 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 351 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  32.13 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  23.02 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  28.51 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  26.52 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  33.33 
 
 		 629 aa  90.9  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  30 
 
 		 357 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 500 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 589 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  30.04 
 
 		 290 aa  90.5  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  28.31 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  26.16 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  30.7 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  25 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  26 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 680 aa  87  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.65 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 449 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  26.79 
 
 		 446 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 473 aa  86.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  26.52 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  28.37 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1140  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00613378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  31.67 
 
 		 357 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.85 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  29.46 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  24.57 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  22.33 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  21.7 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  26.09 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  25 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  26.36 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.44 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  23.85 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.47 
 
 		 1340 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  24.79 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  20.85 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.917759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>